進行超聲經顱多普勒血流分析儀檢查時，檢測者通常取仰臥位，放松狀態。操作步驟如下：
①定位聲窗：檢查者首先在檢測者頭部尋找能穿透顱骨的特定薄弱區域(聲窗)，如顳窗(太陽穴附近)、眼窗(閉合的眼瞼上)和枕窗(后枕部)。
②涂抹耦合劑：在探頭和皮膚之間涂抹耦合劑以確保聲波有效傳導。
③探測血管：將低頻(通常2MHz)探頭置于聲窗上，輕微調整角度和深度，根據血流方向、深度和速度特征來識別特定的顱內動脈，如大腦中動脈(MCA)、大腦前動脈(ACA)等。
④采集數據：一旦找到目標血管，儀器會顯示出血流頻譜，操作者凍結圖像并測量各項血流參數(如流速、PI指數等)。
⑤完成報告：對多條血管進行重復探測后，綜合所有數據，由醫生進行分析并出具檢查報告。整個過程無創快捷，通常需20-30分鐘。
